La Laguna di Varano presenta le sue coste poco diversificate in quanto caratterizzate da rocce che non consentono l’insediamento di altri habitat umidi. In prossimità di Foce Varano, il canale che unisce ad est la laguna con il mare, è presente una zona salmastra inondata che in passato era molto più estesa, denominata Palude o Piana di Muschiaturo. In questo sistema, caratterizzato da lembi di superfici sabbioso-argillose emergenti di pochi cm sul livello di una piana inondabile, è insediato un sistema di vegetazione alofita di ambiente salmastro, caratterizzato da salicornia. Sono gli ultimi lembi di questo habitat d’interesse comunitario presenti lungo le sponde della laguna. Sono ambienti estremamente importanti in quanto sono le uniche aree che ospitano la nidificazione di specie quali Fraticello, Cavaliere d’Italia, Fratino.